Wat Is RNA Sequencing?

RNA sequencing is het bepalen van de sequentie van nucleotiden in een streng van ribonucleïnezuur of RNA. RNA bestaat uit vier nucleotiden genoemd adenine (A), guanine (G), cytosine (S), en uracil (S). De bepaalde volgorde van de nucleotiden een "code" met genetische informatie gebruikt om verschillende soorten eiwitten of bepaalde specifieke functie op zijn eigen opslag. Genetische codes in de vorm van sequenties van nucleotiden definiëren bijna elk biologisch proces dat de ontwikkeling en functie van een organisme. RNA sequentie is dus een soort onderzoek gericht op het ontdekken van de precieze aard van de genetische code en de code specifieke structuren en functies verbinden binnen een organisme.

Wetenschappers sequentie deoxyribonucleïnezuur of DNA, veel vaker dan sequentie RNA. DNA eveneens uit nucleotiden, maar zij worden in een dubbele helix. RNA "transcripten" is feitelijk gebaseerd op de sequentie van nucleotiden op een streng van DNA - DNA neigt robuuster dan RNA omdat veel RNA strengen worden gemaakt uit een sequentie van DNA. Daarnaast DNA bevat "introns" of coderende DNA-segmenten, die zijn uitgegeven tijdens het transcriptieproces en worden daarom niet herkend door RNA sequentie. RNA sequencing blijft belangrijk, maar in veel gevallen noodzakelijk om eerst "reverse transcriberen" RNA naar DNA voor sequencing het.

Het feit dat een RNA-sequentie niet noodzakelijk dezelfde als de DNA-sequentie waarvan werd getranscribeerd is een van de belangrijkste redenen dat wetenschappers daadwerkelijk RNA sequencing experimenten. RNA-sequencing kunnen wetenschappers te ontdekken welke delen van een DNA-template tijdens de transcriptie werden uit uitgegeven. Dit wetende, kunnen ze dan onderzoeken hoe en waarom van de sequentie werd eruit geknipt. Eén van de interessante problemen in de biologie is het feit dat een groot deel van het genoom of sommatie van genetische informatie binnen een organisme, lijkt ongebruikt zijn. Leren precies welke sequenties worden gebruikt en die niet is een belangrijke stap in het verkennen van de fijne kneepjes van deze ongebruikte segmenten van genetische informatie.

De ontwikkeling van meer efficiënte en effectieve methoden van RNA-sequencing is een belangrijke focus van veel onderzoekers in de biotechnologie. Onderzoekers moeten het algemeen reverse-transcriberen van RNA naar DNA voordat het daadwerkelijk nemen van de reeks. Onderzoekers willen methoden die efficiënt directe sequencing van het RNA mogelijk zonder schade aan RNA-strengen te ontwikkelen. Daarnaast onderzoekers willen high-throughput methoden die hen in staat stellen om veel RNA-strengen sequencen tijdens één RNA-sequencing proces te vinden.

  • Wetenschappers vaker sequencen DNA dan RNA.